马庙镇隶属于安徽省怀宁县，地处怀宁县北部，桐城、怀宁、潜山3市（县）交界处，东与金拱镇毗邻，南连高河镇，西接公岭镇、潜山县源潭镇，北隔大沙河与桐城市青草镇相望。
马庙镇版图总面积85.16平方千米，下辖13个行政村、3个社区，总人口49122人（2017）。
2011年，该镇完成农业总产值5.2亿元，工业生产总值36.7亿元。
马庙镇地处丘陵地带，地势西南高、东北低；属亚热带季风气候，光热充足、雨热同期，农业以种植水稻、油菜、棉花等作物为主，主导产业为板材业。