牡丹江经济技术开发区创建于1992年，时名裕民经济开发区，是商务部备案的省级开发区，规划面积6.91平方公里。
重点发展煤化工、生物医药、装备制造等产业。
2006年1月，原裕民经济开发区与江南新城区整合成立牡丹江经济开发区。
同年8月，获批省级高新区，加挂牡丹江高新技术开发区牌子。
2008年，被列为黑龙江省八大经济区之一。
2013年3月，晋升为国家级开发区。